Además, los principales fichajes de esa temporada, Robbie Keane y Hakan Sükür, no cumplieron las expectativas y dejaron el equipo tras solo una temporada. Temporada 2021/22 Conte decide marcharse por diferencias con el futuro de la plantilla, Lukaku €115 millones y Hakimi €60 millones serian los jugadores que se marcharian a cambio se contratan a Simone Inzaghi como nuevo entrenador, Al carrilero Denzel Dumfries, Delantero Edin Džeko y el volante Hakan Çalahanoğlu. Esto hizo que llegara un nuevo entrenador, el exjugador Giampiero Marini, que llevaría al equipo a conseguir su segundo título de Copa de la UEFA con jugadores como Rubén Sosa, Giuseppe Bergomi y Walter Zenga. En la temporada 1996/97 refuerzan al equipo Youri Djorkaeff e Iván Zamorano que junto a Pagliuca, Bergomi y Javier Zanetti el Nerazzurri terminaría en tercer lugar de la Serie A a solo seis puntos del título. Zamorano también dejó el club a mitad de temporada. El 18 de febrero de 1995, Ernesto Pellegrini dejó la presidencia y en su lugar asumió Massimo Moratti como nuevo presidente y propietario del club. En marzo de 1984, Ernesto Pellegrini adquiere la compañía por 7 mil millones de euros. En la Serie A, el conjunto llegó a la última jornada primero en liga y dependiendo de sí mismo para ganarla, pero una derrota privó al equipo de volver a proclamarse campeón del Scudetto.
Salsburgo, primero en Viena, donde el Nerazzurri ganó por 1 a 0 con un gol de Berti. En Serie A Inter lidero los primeros puestos llegando ala última fecha primero en liga siguiéndolo a 1 punto la Juventus y a 2 puntos la AS Roma. En octubre de 2003, Cúper fue cesado y reemplazado por el veterano Alberto Zaccheroni, que dejó al Inter cuarto en la liga. ↑ Marcotti, Gabriele (23 de octubre de 2008). «Becks leaving MLS? Say it ain’t so!». ↑ «Helenio Herrera: mucho más que el ‘catenaccio’». ↑ «Universitario eliminado de la Copa Libertadores: cremas cayeron 1-0 en la vuelta de la fase 2 ante brasil camiseta Barcelona SC». El equipo oscense mostró su incredulidad ante semejante idiotez y por supuesto, la cosa quedó en nada. Sin embargo, no podrían dar vuelta los malos resultados en la Serie A tras una decepcionante campaña de 11 victorias, 9 empates y 14 derrotas, en la cual el equipo finalizó en el puesto N.º 13, a tan solo un punto del descenso. Una relativa estabilidad llegó en la temporada 1999-00 con el nuevo entrenador Marcello Lippi, que llegaba precisamente de triunfar en la Juventus. El Inter cada vez daba más signos de regularidad y volvía a competir con la Juventus y el Milán por el trofeo liguero, terminando como tercer clasificado.
Inter tomaría el liderato en la fecha 4 y defendería la cima las siguientes jornadas venciendo a AC Milán y a Juventus con hat trick de Altobelli. Luego en la fecha 4 caería en el derby della Madonnina ante AC Milan por la disputa en la punta. Tras ser derrotado en la primera jornada de liga ante el Piacenza, camiseta inter de milan Lippi fue despedido. La Juventus fue descendida a la Serie B y perdió los Scudettos de 2005 y 2006, y el Inter, que había quedado tercero tras la Juvetus y el AC Milán, reclamó ala FIGC que se le otorgase el Scudetto de 2006, y finalmente así fue, llegando a su décimo cuarto Scudetto para los Nerazzurri, obteniendo de esa manera un título de liga que le correspondía, en todo caso, al AC Mílan, que había quedado segundo en la tabla. El gran logro del Inter de Milán, para alegría de sus aficionados, es que en 2010 consiguió un histórico quíntuplete, con la liga, la Copa de Italia, la Supercopa de Italia, la Liga de Campeones y el Mundial de Clubes. The club has won over 30 trophies domestically along with 3. Inter Milan 22-23 Home Jersey.
El 4 de septiembre de 2006, falleció el presidente del club de San Siro, Giacinto Facchetti. En esta temporada, Giacinto Facchetti, fue elegido presidente de la entidad, cargo en el cual se desempeñó hasta su fallecimiento en septiembre de 2006. Pese a eso, Moratti siguió siendo el propietario del club. En julio de 2006, se conoció la sentencia por el caso Calciopoli en donde fue condenado Luciano Moggi, dirigente de la Juventus, y al club turinés por la supuesta conversación con los árbitros después de los partidos, en la que también estaba implicado el AC Milan. Mientras que sus grandes rivales, AC Milán y Juventus, estaban logrando el éxito tanto a nivel nacional como en Europa, el Inter se queda atrás, con resultados irregulares finalizando segundo en tabla de posiciones en la Serie A de 1993 y 1998. En la temporada 1993-94, quedaría a tan solo un punto de la zona de descenso.